Protein–RNA interactions for Protein: Q06159

ATG39, Autophagy-related protein 39, yeastyeast

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG39Q06159 HSP104YLL026W 2727 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 EMW1YNL313C 2715 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 GFA1YKL104C 2154 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 PSR2YLR019W 1194 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 DUS4YLR405W 1104 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 SPG5YMR191W 1122 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 AAD14YNL331C 1131 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 FIT2YOR382W 462 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 ERG10YPL028W 1197 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 SPE3YPR069C 882 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 YPR076WYPR076W 375 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG39Q06159 YGL102CYGL102C 429 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 SPG1YGR236C 288 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 YOL046CYOL046C 675 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 RGD2YFL047W 2145 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 GCN3YKR026C 918 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 EHD3YDR036C 1503 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 ALT1YLR089C 1779 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 COX9YDL067C 180 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 YJL144WYJL144W 315 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 YLL056CYLL056C 897 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 RPL31BYLR406C 342 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 MRPL19YNL185C 477 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 SMX3YPR182W 261 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 GPT2YKR067W 2232 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 IVY1YDR229W 1362 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 YMR034CYMR034C 1305 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 ICP55YER078C 1536 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 COX20YDR231C 618 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 MRPS28YDR337W 861 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 TRS31YDR472W 852 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 HIS1YER055C 894 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 AGX1YFL030W 1158 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 PRI1YIR008C 1230 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 ICS3YJL077C 396 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 CUE4YML101C 354 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 RPS28AYOR167C 204 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 COX15YER141W 1461 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 PLB3YOL011W 2061 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 BIO3YNR058W 1443 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 ASN1YPR145W 1719 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 STB5YHR178W 2232 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 RNR3YIL066C 2610 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 PPH21YDL134C 1110 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 LDB7YBL006C 543 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 PEX31YGR004W 1389 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 NUP49YGL172W 1419 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 MSC3YLR219W 2187 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 URH1YDR400W 1023 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 YKR032WYKR032W 315 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 CPA1YOR303W 1236 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 MPH3YJR160C 1809 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 NTE1YML059C 5040 nt5.21□□□□□ -1.57
ATG39Q06159 GUP2YPL189W 1830 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 DYS1YHR068W 1164 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 CBR1YIL043C 855 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 PUS4YNL292W 1212 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 ASR1YPR093C 867 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 MIP1YOR330C 3765 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 SES1YDR023W 1389 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 GPA2YER020W 1350 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 YDL177CYDL177C 513 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 YSC83YHR017W 1158 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 HOC1YJR075W 1191 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 YIR007WYIR007W 2295 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 AMA1YGR225W 1782 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 PAP2YOL115W 1755 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 PYK2YOR347C 1521 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 VBA1YMR088C 1689 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 HED1YDR014W-A 489 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 LIA1YJR070C 978 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 SWD1YAR003W 1281 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 COX5AYNL052W 462 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 TMA46YOR091W 1038 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 FLC3YGL139W 2409 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 PTK2YJR059W 2457 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 YML133CYML133C 4125 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 CYS4YGR155W 1524 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 SET5YHR207C 1581 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 YJL171CYJL171C 1191 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 YNL092WYNL092W 1203 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 MRPS12YNR036C 462 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 SEC62YPL094C 825 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 ADH5YBR145W 1056 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 MCM6YGL201C 3054 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 CLB2YPR119W 1476 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 YJR107WYJR107W 987 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 PPM2YOL141W 2088 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 FMP40YPL222W 2067 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 ERG7YHR072W 2196 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 AAP1YHR047C 2571 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 YHR020WYHR020W 2067 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 GPD1YDL022W 1176 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 YDR415CYDR415C 1125 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 MKK2YPL140C 1521 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 ROG3YFR022W 2202 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG39Q06159 ALD6YPL061W 1503 nt5.15□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.8 ms