Protein–RNA interactions for Protein: Q06102

YTH1, mRNA 3'-end-processing protein YTH1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YTH1Q06102 YRB2YIL063C 984 nt5.55□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 RSP5YER125W 2430 nt5.54□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.54□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 TDH2YJR009C 999 nt5.54□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 CCP1YKR066C 1086 nt5.54□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 PUS5YLR165C 765 nt5.54□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 YAR064WYAR064W 300 nt5.54□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 TAE1YBR261C 699 nt5.54□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 STT3YGL022W 2157 nt5.54□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 CBK1YNL161W 2271 nt5.54□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 FPR2YDR519W 408 nt5.53□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 HEM2YGL040C 1029 nt5.53□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 YML018CYML018C 1182 nt5.53□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 DFR1YOR236W 636 nt5.53□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 YPL071CYPL071C 471 nt5.53□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 SGF29YCL010C 780 nt5.53□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 COX10YPL172C 1389 nt5.53□□□□□ -1.52
YTH1Q06102 UIP5YKR044W 1332 nt5.52□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 GSH1YJL101C 2037 nt5.52□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 CCT8YJL008C 1707 nt5.52□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 FZF1YGL254W 900 nt5.52□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 THI4YGR144W 981 nt5.52□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 IRC11YOR013W 471 nt5.52□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 PPM2YOL141W 2088 nt5.52□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 MLS1YNL117W 1665 nt5.51□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 HXT17YNR072W 1695 nt5.51□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 ERS1YCR075C 783 nt5.51□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 PAC10YGR078C 600 nt5.51□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 MTR3YGR158C 753 nt5.51□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 NAS6YGR232W 687 nt5.51□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 CTF19YPL018W 1110 nt5.51□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 HBN1YCL026C-B 582 nt5.51□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 MCH2YKL221W 1422 nt5.5□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 SEM1YDR363W-A 270 nt5.5□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 VMA3YEL027W 483 nt5.5□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 MSP1YGR028W 1089 nt5.5□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 TAH11YJR046W 1815 nt5.5□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 YDR387CYDR387C 1668 nt5.5□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 YBR284WYBR284W 2394 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 HHY1YEL059W 309 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 FHN1YGR131W 525 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 AIM2YAL049C 741 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 MSO1YNR049C 633 nt5.49□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 ZWF1YNL241C 1518 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 snR82snR82 268 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 ATG36YJL185C 882 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 AVO2YMR068W 1281 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 YNR014WYNR014W 639 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 RFC4YOL094C 972 nt5.48□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 EFM1YHL039W 1758 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 SEC23YPR181C 2307 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 YGR054WYGR054W 1929 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 ARE2YNR019W 1929 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 PPH22YDL188C 1134 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 MPC2YHR162W 390 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 SCS7YMR272C 1155 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 YMR295CYMR295C 594 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 RNH201YNL072W 924 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 ARC35YNR035C 1029 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 FSF1YOR271C 984 nt5.47□□□□□ -1.53
YTH1Q06102 FAL1YDR021W 1200 nt5.46□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 YHC3YJL059W 1227 nt5.46□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 SRL2YLR082C 1179 nt5.46□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 ATG17YLR423C 1254 nt5.46□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 SWP1YMR149W 861 nt5.46□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 YPL257WYPL257W 582 nt5.46□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 YBR241CYBR241C 1467 nt5.45□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 YIL055CYIL055C 1884 nt5.45□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 YFR006WYFR006W 1608 nt5.45□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 YIL077CYIL077C 963 nt5.45□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 LYS1YIR034C 1122 nt5.45□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 MRPL10YNL284C 969 nt5.45□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 YMR279CYMR279C 1623 nt5.45□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 CYB2YML054C 1776 nt5.44□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 YJR146WYJR146W 354 nt5.44□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 QRI5YLR204W 336 nt5.44□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 YNL165WYNL165W 1221 nt5.44□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 YOR300WYOR300W 309 nt5.44□□□□□ -1.54
YTH1Q06102 PTC4YBR125C 1182 nt5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.8 ms