Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 AAD14YNL331C 1131 nt6.8□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 EHT1YBR177C 1356 nt6.8□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 PPZ2YDR436W 2133 nt6.79□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 ATG32YIL146C 1590 nt6.79□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 VMA2YBR127C 1554 nt6.79□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 SNF11YDR073W 510 nt6.79□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 SOH1YGL127C 384 nt6.79□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 XPT1YJR133W 630 nt6.79□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 OAZ1YPL052W 879 nt6.79□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 RPO26YPR187W 468 nt6.79□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 LDB19YOR322C 2457 nt6.79□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 PXL1YKR090W 2121 nt6.79□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 SSC1YJR045C 1965 nt6.78□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 POB3YML069W 1659 nt6.78□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 ATP12YJL180C 978 nt6.78□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 NCE103YNL036W 666 nt6.78□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 RAD17YOR368W 1206 nt6.78□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 VPS28YPL065W 729 nt6.78□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 DIP5YPL265W 1827 nt6.78□□□□□ -1.32
SRP1Q02821 YMR027WYMR027W 1413 nt6.77□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 SHC1YER096W 1539 nt6.77□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 ARO9YHR137W 1542 nt6.77□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 POR2YIL114C 846 nt6.77□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 YLR162WYLR162W 357 nt6.77□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 PTH2YBL057C 627 nt6.77□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 PRP46YPL151C 1356 nt6.77□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.76□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 YGL072CYGL072C 360 nt6.76□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 RCF1YML030W 480 nt6.76□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 MED4YOR174W 855 nt6.76□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 YKR018CYKR018C 2178 nt6.75□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 YOR389WYOR389W 1875 nt6.75□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 KTR4YBR199W 1395 nt6.75□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 NCS6YGL211W 1080 nt6.75□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 YGR137WYGR137W 375 nt6.75□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 MFA2YNL145W 117 nt6.75□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 PMT1YDL095W 2454 nt6.75□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 STD1YOR047C 1335 nt6.75□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 DEF1YKL054C 2217 nt6.74□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 PTR2YKR093W 1806 nt6.74□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 YLL017WYLL017W 312 nt6.74□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 NEJ1YLR265C 1029 nt6.74□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 CTR3YLR411W 726 nt6.74□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt6.74□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 MCP1YOR228C 909 nt6.74□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 UBS1YBR165W 834 nt6.74□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 AAD6YFL056C 639 nt6.73□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 PUS4YNL292W 1212 nt6.73□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 DDC1YPL194W 1839 nt6.73□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 YBR284WYBR284W 2394 nt6.73□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 GUS1YGL245W 2127 nt6.73□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 PGI1YBR196C 1665 nt6.72□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 MSI1YBR195C 1269 nt6.72□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 NOG2YNR053C 1461 nt6.72□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 EMP65YER140W 1671 nt6.71□□□□□ -1.33
SRP1Q02821 VMS1YDR049W 1899 nt6.71□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 YEL028WYEL028W 462 nt6.71□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 MED6YHR058C 888 nt6.71□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 RUF21RUF21 707 nt6.71□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 BPL1YDL141W 2073 nt6.71□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 POP1YNL221C 2628 nt6.71□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 ARG7YMR062C 1326 nt6.71□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 LPL1YOR059C 1353 nt6.7□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 ARO3YDR035W 1113 nt6.7□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 AIM46YHR199C 933 nt6.7□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 NCA3YJL116C 1014 nt6.7□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 OAC1YKL120W 975 nt6.7□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 YOL050CYOL050C 321 nt6.7□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 MIF2YKL089W 1650 nt6.7□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 PPS1YBR276C 2424 nt6.69□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 PHM8YER037W 966 nt6.69□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 MPS2YGL075C 1164 nt6.69□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 STS1YIR011C 960 nt6.69□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 YKR104WYKR104W 921 nt6.69□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 HXT8YJL214W 1710 nt6.69□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 SUB2YDL084W 1341 nt6.69□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 SET5YHR207C 1581 nt6.69□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 PMT2YAL023C 2280 nt6.69□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 SEC24YIL109C 2781 nt6.69□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 HXT2YMR011W 1626 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 TKL1YPR074C 2043 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 DHH1YDL160C 1521 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 RTT103YDR289C 1230 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 TRP4YDR354W 1143 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 PFA4YOL003C 1137 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 DAP1YPL170W 459 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 NEM1YHR004C 1341 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 SIT1YEL065W 1887 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 NFI1YOR156C 2181 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 GPT2YKR067W 2232 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 IPI3YNL182C 1668 nt6.68□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 MSP1YGR028W 1089 nt6.67□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 YIL077CYIL077C 963 nt6.67□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 PML1YLR016C 615 nt6.67□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 YLR198CYLR198C 360 nt6.67□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 YPQ1YOL092W 927 nt6.67□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 SSP2YOR242C 1116 nt6.67□□□□□ -1.34
SRP1Q02821 CST26YBR042C 1194 nt6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 99 ms