Protein–RNA interactions for Protein: P42932

Cct8, T-complex protein 1 subunit theta, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct8P42932 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cct8P42932 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct8P42932 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct8P42932 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cct8P42932 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cct8P42932 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct8P42932 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct8P42932 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cct8P42932 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cct8P42932 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct8P42932 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cct8P42932 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms