Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 YNL092WYNL092W 1203 nt5.52□□□□□ -1.53
AVT5P38176 YPL067CYPL067C 597 nt5.52□□□□□ -1.53
AVT5P38176 PFK2YMR205C 2880 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT5P38176 RHO4YKR055W 876 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT5P38176 ATP4YPL078C 735 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT5P38176 YBR124WYBR124W 360 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT5P38176 AMA1YGR225W 1782 nt5.51□□□□□ -1.53
AVT5P38176 YMR279CYMR279C 1623 nt5.5□□□□□ -1.53
AVT5P38176 TRR2YHR106W 1029 nt5.5□□□□□ -1.53
AVT5P38176 KAE1YKR038C 1161 nt5.5□□□□□ -1.53
AVT5P38176 YHM2YMR241W 945 nt5.5□□□□□ -1.53
AVT5P38176 PRS4YBL068W 981 nt5.5□□□□□ -1.53
AVT5P38176 HXT15YDL245C 1704 nt5.5□□□□□ -1.53
AVT5P38176 HXT16YJR158W 1704 nt5.5□□□□□ -1.53
AVT5P38176 VPS5YOR069W 2028 nt5.5□□□□□ -1.53
AVT5P38176 TRS31YDR472W 852 nt5.49□□□□□ -1.53
AVT5P38176 HGH1YGR187C 1185 nt5.49□□□□□ -1.53
AVT5P38176 HTZ1YOL012C 405 nt5.49□□□□□ -1.53
AVT5P38176 NTG2YOL043C 1143 nt5.49□□□□□ -1.53
AVT5P38176 YPR130CYPR130C 408 nt5.49□□□□□ -1.53
AVT5P38176 ALD6YPL061W 1503 nt5.48□□□□□ -1.53
AVT5P38176 MIP1YOR330C 3765 nt5.48□□□□□ -1.53
AVT5P38176 NTE1YML059C 5040 nt5.48□□□□□ -1.53
AVT5P38176 HIS7YBR248C 1659 nt5.48□□□□□ -1.53
AVT5P38176 VPS61YDR136C 573 nt5.48□□□□□ -1.53
AVT5P38176 ATG17YLR423C 1254 nt5.48□□□□□ -1.53
AVT5P38176 YPQ1YOL092W 927 nt5.48□□□□□ -1.53
AVT5P38176 MKK2YPL140C 1521 nt5.48□□□□□ -1.53
AVT5P38176 GPB2YAL056W 2643 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT5P38176 FET4YMR319C 1659 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT5P38176 GPA2YER020W 1350 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT5P38176 PTC7YHR076W 1032 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT5P38176 YNR005CYNR005C 405 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT5P38176 IRC11YOR013W 471 nt5.47□□□□□ -1.53
AVT5P38176 CIA1YDR267C 993 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT5P38176 FBA1YKL060C 1080 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YML079WYML079W 606 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT5P38176 SPG5YMR191W 1122 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YFL042CYFL042C 2025 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YMR034CYMR034C 1305 nt5.46□□□□□ -1.54
AVT5P38176 APE4YHR113W 1473 nt5.45□□□□□ -1.54
AVT5P38176 CCC2YDR270W 3015 nt5.45□□□□□ -1.54
AVT5P38176 UME1YPL139C 1383 nt5.45□□□□□ -1.54
AVT5P38176 XBP1YIL101C 1944 nt5.45□□□□□ -1.54
AVT5P38176 OST3YOR085W 1053 nt5.45□□□□□ -1.54
AVT5P38176 CST26YBR042C 1194 nt5.45□□□□□ -1.54
AVT5P38176 SPS22YCL048W 1392 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YDL177CYDL177C 513 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 RPP1YHR062C 882 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 REC107YJR021C 945 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 GEP5YLR091W 882 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 CHS5YLR330W 2016 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 MBF1YOR298C-A 456 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 MRP51YPL118W 1035 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 snR30snR30 606 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YCL049CYCL049C 939 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 SKI2YLR398C 3864 nt5.44□□□□□ -1.54
AVT5P38176 PDA1YER178W 1263 nt5.43□□□□□ -1.54
AVT5P38176 SPG1YGR236C 288 nt5.43□□□□□ -1.54
AVT5P38176 CBR1YIL043C 855 nt5.43□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.43□□□□□ -1.54
AVT5P38176 HSP104YLL026W 2727 nt5.43□□□□□ -1.54
AVT5P38176 MRPL1YDR116C 858 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT5P38176 MRPS28YDR337W 861 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT5P38176 HST2YPL015C 1074 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT5P38176 NSE5YML023C 1671 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT5P38176 THI2YBR240C 1353 nt5.42□□□□□ -1.54
AVT5P38176 LDB19YOR322C 2457 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YIR007WYIR007W 2295 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 SCT1YBL011W 2280 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 BUR6YER159C 429 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 PUP2YGR253C 783 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YSC83YHR017W 1158 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 EFM3YJR129C 1020 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 RPL31BYLR406C 342 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 SWP1YMR149W 861 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 PRP24YMR268C 1335 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 CMR1YDL156W 1569 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YFL052WYFL052W 1398 nt5.41□□□□□ -1.54
AVT5P38176 FZF1YGL254W 900 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT5P38176 ORM1YGR038W 669 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YLR162WYLR162W 357 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YLR296WYLR296W 327 nt5.4□□□□□ -1.54
AVT5P38176 YHL017WYHL017W 1599 nt5.4□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.6 ms