Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxa5P09021 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa5P09021 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa5P09021 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms