Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ift43Q9DA69 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ift43Q9DA69 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ift43Q9DA69 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift43Q9DA69 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms