Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Tube1Q9D6T1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tube1Q9D6T1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tube1Q9D6T1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms