Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D1F3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D1F3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9D1F3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D1F3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9D1F3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D1F3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D1F3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D1F3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D1F3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D1F3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q9D1F3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D1F3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Q9D1F3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms