Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Spock3Q8BKV0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spock3Q8BKV0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Spock3Q8BKV0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Spock3Q8BKV0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms