Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp1Q8BJQ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp1Q8BJQ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp1Q8BJQ2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp1Q8BJQ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp1Q8BJQ2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp1Q8BJQ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp1Q8BJQ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp1Q8BJQ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms