Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 ADH5YBR145W 1056 nt6.52□□□□□ -1.37
HER1Q12276 YFL052WYFL052W 1398 nt6.52□□□□□ -1.37
HER1Q12276 DMC1YER179W 1005 nt6.51□□□□□ -1.37
HER1Q12276 RMA1YKL132C 1293 nt6.51□□□□□ -1.37
HER1Q12276 YNL200CYNL200C 741 nt6.51□□□□□ -1.37
HER1Q12276 KNS1YLL019C 2214 nt6.51□□□□□ -1.37
HER1Q12276 NOG2YNR053C 1461 nt6.51□□□□□ -1.37
HER1Q12276 CMR1YDL156W 1569 nt6.51□□□□□ -1.37
HER1Q12276 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.5□□□□□ -1.37
HER1Q12276 POR2YIL114C 846 nt6.5□□□□□ -1.37
HER1Q12276 GCN3YKR026C 918 nt6.5□□□□□ -1.37
HER1Q12276 YCR049CYCR049C 447 nt6.49□□□□□ -1.37
HER1Q12276 YUR1YJL139C 1287 nt6.49□□□□□ -1.37
HER1Q12276 AIM33YML087C 939 nt6.49□□□□□ -1.37
HER1Q12276 PUS4YNL292W 1212 nt6.49□□□□□ -1.37
HER1Q12276 GAA1YLR088W 1845 nt6.48□□□□□ -1.37
HER1Q12276 YJR107WYJR107W 987 nt6.48□□□□□ -1.37
HER1Q12276 ISC1YER019W 1434 nt6.48□□□□□ -1.37
HER1Q12276 NAF1YNL124W 1479 nt6.47□□□□□ -1.37
HER1Q12276 YML122CYML122C 381 nt6.47□□□□□ -1.37
HER1Q12276 DPM1YPR183W 804 nt6.47□□□□□ -1.37
HER1Q12276 AVT4YNL101W 2142 nt6.47□□□□□ -1.37
HER1Q12276 UME1YPL139C 1383 nt6.46□□□□□ -1.37
HER1Q12276 HIS1YER055C 894 nt6.46□□□□□ -1.38
HER1Q12276 PUS5YLR165C 765 nt6.46□□□□□ -1.38
HER1Q12276 PTH2YBL057C 627 nt6.46□□□□□ -1.38
HER1Q12276 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.46□□□□□ -1.38
HER1Q12276 YBL070CYBL070C 321 nt6.46□□□□□ -1.38
HER1Q12276 MCP1YOR228C 909 nt6.46□□□□□ -1.38
HER1Q12276 CIT2YCR005C 1383 nt6.45□□□□□ -1.38
HER1Q12276 TKL2YBR117C 2046 nt6.45□□□□□ -1.38
HER1Q12276 TRS31YDR472W 852 nt6.45□□□□□ -1.38
HER1Q12276 YPL067CYPL067C 597 nt6.44□□□□□ -1.38
HER1Q12276 ELP3YPL086C 1674 nt6.44□□□□□ -1.38
HER1Q12276 CEF1YMR213W 1773 nt6.44□□□□□ -1.38
HER1Q12276 SES1YDR023W 1389 nt6.44□□□□□ -1.38
HER1Q12276 ARG81YML099C 2643 nt6.43□□□□□ -1.38
HER1Q12276 YKR032WYKR032W 315 nt6.43□□□□□ -1.38
HER1Q12276 AAD14YNL331C 1131 nt6.43□□□□□ -1.38
HER1Q12276 YPQ1YOL092W 927 nt6.43□□□□□ -1.38
HER1Q12276 TFC6YDR362C 2019 nt6.43□□□□□ -1.38
HER1Q12276 FHN1YGR131W 525 nt6.42□□□□□ -1.38
HER1Q12276 CYS3YAL012W 1185 nt6.42□□□□□ -1.38
HER1Q12276 TOS6YNL300W 309 nt6.42□□□□□ -1.38
HER1Q12276 YPR204WYPR204W 3099 nt6.42□□□□□ -1.38
HER1Q12276 YPQ2YDR352W 954 nt6.41□□□□□ -1.38
HER1Q12276 YDR415CYDR415C 1125 nt6.41□□□□□ -1.38
HER1Q12276 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.41□□□□□ -1.38
HER1Q12276 CDC11YJR076C 1248 nt6.41□□□□□ -1.38
HER1Q12276 COX5AYNL052W 462 nt6.41□□□□□ -1.38
HER1Q12276 JIP4YDR475C 2631 nt6.41□□□□□ -1.38
HER1Q12276 BUR6YER159C 429 nt6.4□□□□□ -1.38
HER1Q12276 AIM46YHR199C 933 nt6.4□□□□□ -1.38
HER1Q12276 RTC4YNL254C 1206 nt6.39□□□□□ -1.39
HER1Q12276 MBF1YOR298C-A 456 nt6.39□□□□□ -1.39
HER1Q12276 NFS1YCL017C 1494 nt6.39□□□□□ -1.39
HER1Q12276 YDL177CYDL177C 513 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 GAL83YER027C 1254 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 QCR6YFR033C 444 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 BNS1YGR230W 414 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 TRR2YHR106W 1029 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 REC114YMR133W 1287 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 PRS4YBL068W 981 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 ZIM17YNL310C 525 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 HST2YPL015C 1074 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 CST26YBR042C 1194 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 SPE3YPR069C 882 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 DML1YMR211W 1428 nt6.38□□□□□ -1.39
HER1Q12276 RIO1YOR119C 1455 nt6.37□□□□□ -1.39
HER1Q12276 CBR1YIL043C 855 nt6.37□□□□□ -1.39
HER1Q12276 YHM2YMR241W 945 nt6.37□□□□□ -1.39
HER1Q12276 IRC11YOR013W 471 nt6.37□□□□□ -1.39
HER1Q12276 LGE1YPL055C 999 nt6.37□□□□□ -1.39
HER1Q12276 MSN2YMR037C 2115 nt6.37□□□□□ -1.39
HER1Q12276 PAP2YOL115W 1755 nt6.36□□□□□ -1.39
HER1Q12276 YLL058WYLL058W 1728 nt6.36□□□□□ -1.39
HER1Q12276 HEM1YDR232W 1647 nt6.36□□□□□ -1.39
HER1Q12276 OPT1YJL212C 2400 nt6.36□□□□□ -1.39
HER1Q12276 TUB1YML085C 1344 nt6.36□□□□□ -1.39
HER1Q12276 CIS3YJL158C 684 nt6.36□□□□□ -1.39
HER1Q12276 PEX13YLR191W 1161 nt6.36□□□□□ -1.39
HER1Q12276 MIP1YOR330C 3765 nt6.36□□□□□ -1.39
HER1Q12276 PLB3YOL011W 2061 nt6.36□□□□□ -1.39
HER1Q12276 GUF1YLR289W 1938 nt6.36□□□□□ -1.39
HER1Q12276 RAP1YNL216W 2484 nt6.35□□□□□ -1.39
HER1Q12276 PMP3YDR276C 168 nt6.35□□□□□ -1.39
HER1Q12276 YPT1YFL038C 621 nt6.35□□□□□ -1.39
HER1Q12276 ICS3YJL077C 396 nt6.35□□□□□ -1.39
HER1Q12276 PMT3YOR321W 2262 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 MPE1YKL059C 1326 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.34□□□□□ -1.39
HER1Q12276 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 209.1 ms