Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 MDM31YHR194W 1740 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 LSB6YJL100W 1824 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 SPR3YGR059W 1539 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 RNA15YGL044C 891 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 DAT1YML113W 747 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 CEG1YGL130W 1380 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 DBP5YOR046C 1449 nt8.2□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 DLD3YEL071W 1491 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 BSC5YNR069C 1470 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 AAD6YFL056C 639 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 SPO7YAL009W 780 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 RCN1YKL159C 636 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YLR415CYLR415C 339 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 NTG2YOL043C 1143 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 DBP1YPL119C 1854 nt8.19□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 PMT2YAL023C 2280 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 GPM2YDL021W 936 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 NSE4YDL105W 1209 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 AIR2YDL175C 1035 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 NIT1YIL164C 600 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YJL195CYJL195C 702 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 AIM25YJR100C 984 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YKL123WYKL123W 381 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 MIA40YKL195W 1212 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YKR045CYKR045C 552 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 OPI10YOL032W 741 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 MPD2YOL088C 834 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 APA1YCL050C 966 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 KES1YPL145C 1305 nt8.18□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 SLS1YLR139C 1932 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 TGL2YDR058C 981 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 UPS3YDR185C 540 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 SPT3YDR392W 1014 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 STS1YIR011C 960 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 TIM17YJL143W 477 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 MBR1YKL093W 1020 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 SPE4YLR146C 903 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 NCE103YNL036W 666 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 MIC27YNL100W 705 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 CPR8YNR028W 927 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 CSI2YOL007C 1026 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 HNT3YOR258W 654 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YPR071WYPR071W 636 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 GTB1YDR221W 2109 nt8.17□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 QRI7YDL104C 1224 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 EFM3YJR129C 1020 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 BDH1YAL060W 1149 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 RIT1YMR283C 1542 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YPK3YBR028C 1578 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 MED8YBR193C 672 nt8.16□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 SAD1YFR005C 1347 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 OSH7YHR001W 1314 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YEL028WYEL028W 462 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 TFG2YGR005C 1203 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 SHY1YGR112W 1170 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 ATP20YPR020W 348 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 RPL21AYBR191W 483 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YCL041CYCL041C 495 nt8.15□□□□□ -1.1
TY1A-BRQ12217 YHR218WYHR218W 1812 nt8.15□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 DMA2YNL116W 1569 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 ENP1YBR247C 1452 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 CTF13YMR094W 1437 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 HOS1YPR068C 1413 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 NOB1YOR056C 1380 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 SRO9YCL037C 1305 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 MND2YIR025W 1107 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 YLR156WYLR156W 345 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 YLR159WYLR159W 345 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 YLR161WYLR161W 345 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 CPR6YLR216C 1116 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 YML099W-AYML099W-A 330 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 TAF3YPL011C 1062 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 CIN2YPL241C 807 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 GAP1YKR039W 1809 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 CCT2YIL142W 1584 nt8.14□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 ESBP6YNL125C 2022 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 AVT2YEL064C 1443 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 YDL162CYDL162C 357 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 COBQ0105 1158 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 YIL082WYIL082W 873 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 TFA2YKR062W 987 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 SMD3YLR147C 306 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 IMD1YAR073W 1212 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 ELC1YPL046C 300 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 MRL1YPR079W 1146 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 BET2YPR176C 978 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 AAC3YBR085W 924 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 ELP3YPL086C 1674 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 LAS1YKR063C 1509 nt8.13□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 ERV14YGL054C 417 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 YGR114CYGR114C 390 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 ARD1YHR013C 717 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 YBL062WYBL062W 381 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 CKB2YOR039W 777 nt8.12□□□□□ -1.11
TY1A-BRQ12217 FIG1YBR040W 897 nt8.12□□□□□ -1.11
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