Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 AAT2YLR027C 1257 nt8.25□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 RUF23RUF23 254 nt8.25□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 HXT9YJL219W 1704 nt8.25□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 YDL218WYDL218W 954 nt8.24□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 GTO3YMR251W 1101 nt8.24□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 DON1YDR273W 1098 nt8.23□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 YJR146WYJR146W 354 nt8.23□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 YNL017CYNL017C 339 nt8.23□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt8.23□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 HXK1YFR053C 1458 nt8.23□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 CEM1YER061C 1329 nt8.23□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 MTF2YDL044C 1323 nt8.22□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 STT3YGL022W 2157 nt8.21□□□□□ -1.09
SLM3Q12093 YJR154WYJR154W 1041 nt8.21□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 SHP1YBL058W 1272 nt8.21□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 YPL257WYPL257W 582 nt8.21□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 OGG1YML060W 1131 nt8.2□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 YGR054WYGR054W 1929 nt8.2□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 RMD8YFR048W 1989 nt8.2□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 YBR241CYBR241C 1467 nt8.19□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 PAC2YER007W 1557 nt8.19□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 YDR015CYDR015C 240 nt8.19□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 YJR084WYJR084W 1272 nt8.19□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 CRF1YDR223W 1404 nt8.19□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 PRY3YJL078C 2646 nt8.18□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 LOT6YLR011W 576 nt8.18□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 YLR126CYLR126C 756 nt8.18□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 YNL285WYNL285W 372 nt8.18□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 SKS1YPL026C 1509 nt8.18□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 MRPL28YDR462W 444 nt8.17□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 IRC11YOR013W 471 nt8.17□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 YLL066CYLL066C 3618 nt8.17□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 YLL067CYLL067C 3618 nt8.17□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 PPT1YGR123C 1542 nt8.16□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 GCV3YAL044C 513 nt8.16□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 AMN1YBR158W 1650 nt8.16□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 ENB1YOL158C 1821 nt8.15□□□□□ -1.1
SLM3Q12093 POX1YGL205W 2247 nt8.14□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 OPI11YPR044C 354 nt8.14□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 SNT309YPR101W 528 nt8.14□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 FRE6YLL051C 2139 nt8.14□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 MAK31YCR020C-A 267 nt8.13□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 snR82snR82 268 nt8.13□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 ELA1YNL230C 1140 nt8.13□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 SUF16tG(GCC)C 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 SUF20tG(GCC)F1 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 SUF23tG(GCC)J2 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 SUF17tG(GCC)O2 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 MTC2YKL098W 1074 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 KSH1YNL024C-A 219 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 MRPS12YNR036C 462 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.12□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt8.11□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 MDE1YJR024C 735 nt8.11□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 RPS5YJR123W 678 nt8.11□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 MNS1YJR131W 1650 nt8.11□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 RPN11YFR004W 921 nt8.1□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt8.1□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt8.09□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 RSC30YHR056C 2652 nt8.09□□□□□ -1.11
SLM3Q12093 EDE1YBL047C 4146 nt8.08□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 YCR041WYCR041W 333 nt8.08□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 PRS2YER099C 957 nt8.08□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 DFR1YOR236W 636 nt8.08□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 LDB16YCL005W 771 nt8.08□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 YKR018CYKR018C 2178 nt8.07□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 SNF4YGL115W 969 nt8.07□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 JNM1YMR294W 1122 nt8.07□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 ECM31YBR176W 939 nt8.07□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 MET30YIL046W 1923 nt8.07□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 ICL1YER065C 1674 nt8.06□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 HEM2YGL040C 1029 nt8.06□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 RDN5-2RDN5-2 119 nt8.06□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 RDN5-3RDN5-3 119 nt8.06□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 RDN5-4RDN5-4 119 nt8.06□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 RDN5-5RDN5-5 119 nt8.06□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 CAF40YNL288W 1122 nt8.06□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 RGD2YFL047W 2145 nt8.06□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 NHA1YLR138W 2958 nt8.05□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 YET3YDL072C 612 nt8.05□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 DFM1YDR411C 1026 nt8.05□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 ECM14YHR132C 1293 nt8.05□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 ASK1YKL052C 879 nt8.05□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 MIA40YKL195W 1212 nt8.05□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 RPS3YNL178W 723 nt8.05□□□□□ -1.12
SLM3Q12093 UTP4YDR324C 2331 nt8.04□□□□□ -1.12
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