Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CirbpP60824 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CirbpP60824 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CirbpP60824 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CirbpP60824 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CirbpP60824 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CirbpP60824 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CirbpP60824 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CirbpP60824 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CirbpP60824 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CirbpP60824 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CirbpP60824 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CirbpP60824 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CirbpP60824 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CirbpP60824 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CirbpP60824 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CirbpP60824 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CirbpP60824 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CirbpP60824 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CirbpP60824 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms