Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 YLR173WYLR173W 1827 nt7.23□□□□□ -1.25
VFA1P40080 CDC13YDL220C 2775 nt7.23□□□□□ -1.25
VFA1P40080 HSP12YFL014W 330 nt7.22□□□□□ -1.25
VFA1P40080 COQ1YBR003W 1422 nt7.21□□□□□ -1.25
VFA1P40080 HEM1YDR232W 1647 nt7.21□□□□□ -1.26
VFA1P40080 YDR415CYDR415C 1125 nt7.21□□□□□ -1.26
VFA1P40080 YNL092WYNL092W 1203 nt7.21□□□□□ -1.26
VFA1P40080 TMA46YOR091W 1038 nt7.21□□□□□ -1.26
VFA1P40080 MCP1YOR228C 909 nt7.21□□□□□ -1.26
VFA1P40080 LGE1YPL055C 999 nt7.21□□□□□ -1.26
VFA1P40080 HIS1YER055C 894 nt7.2□□□□□ -1.26
VFA1P40080 HEM2YGL040C 1029 nt7.2□□□□□ -1.26
VFA1P40080 ATG36YJL185C 882 nt7.2□□□□□ -1.26
VFA1P40080 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.2□□□□□ -1.26
VFA1P40080 BDF2YDL070W 1917 nt7.19□□□□□ -1.26
VFA1P40080 YPT1YFL038C 621 nt7.19□□□□□ -1.26
VFA1P40080 SWD1YAR003W 1281 nt7.19□□□□□ -1.26
VFA1P40080 CUE4YML101C 354 nt7.19□□□□□ -1.26
VFA1P40080 SPE3YPR069C 882 nt7.19□□□□□ -1.26
VFA1P40080 PPH21YDL134C 1110 nt7.18□□□□□ -1.26
VFA1P40080 YJL144WYJL144W 315 nt7.18□□□□□ -1.26
VFA1P40080 EDE1YBL047C 4146 nt7.17□□□□□ -1.26
VFA1P40080 MAK32YCR019W 1092 nt7.17□□□□□ -1.26
VFA1P40080 LDB7YBL006C 543 nt7.17□□□□□ -1.26
VFA1P40080 YKR032WYKR032W 315 nt7.16□□□□□ -1.26
VFA1P40080 DFR1YOR236W 636 nt7.16□□□□□ -1.26
VFA1P40080 ASR1YPR093C 867 nt7.16□□□□□ -1.26
VFA1P40080 BIO3YNR058W 1443 nt7.16□□□□□ -1.26
VFA1P40080 CTF8YHR191C 402 nt7.15□□□□□ -1.26
VFA1P40080 YJL211CYJL211C 444 nt7.15□□□□□ -1.26
VFA1P40080 YKL077WYKL077W 1179 nt7.15□□□□□ -1.26
VFA1P40080 SUR7YML052W 909 nt7.15□□□□□ -1.26
VFA1P40080 COS10YNR075W 1125 nt7.15□□□□□ -1.26
VFA1P40080 MSB3YNL293W 1902 nt7.15□□□□□ -1.27
VFA1P40080 ARP3YJR065C 1350 nt7.14□□□□□ -1.27
VFA1P40080 MPH3YJR160C 1809 nt7.14□□□□□ -1.27
VFA1P40080 FBA1YKL060C 1080 nt7.14□□□□□ -1.27
VFA1P40080 YKL102CYKL102C 306 nt7.14□□□□□ -1.27
VFA1P40080 DID2YKR035W-A 615 nt7.14□□□□□ -1.27
VFA1P40080 SWP1YMR149W 861 nt7.14□□□□□ -1.27
VFA1P40080 REG2YBR050C 1017 nt7.14□□□□□ -1.27
VFA1P40080 EEB1YPL095C 1371 nt7.13□□□□□ -1.27
VFA1P40080 MIA40YKL195W 1212 nt7.13□□□□□ -1.27
VFA1P40080 MRPL23YOR150W 492 nt7.13□□□□□ -1.27
VFA1P40080 YBR113WYBR113W 483 nt7.13□□□□□ -1.27
VFA1P40080 ICL2YPR006C 1728 nt7.13□□□□□ -1.27
VFA1P40080 COX15YER141W 1461 nt7.12□□□□□ -1.27
VFA1P40080 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt7.12□□□□□ -1.27
VFA1P40080 FMP40YPL222W 2067 nt7.12□□□□□ -1.27
VFA1P40080 FRA1YLL029W 2250 nt7.11□□□□□ -1.27
VFA1P40080 CCC2YDR270W 3015 nt7.11□□□□□ -1.27
VFA1P40080 YJR146WYJR146W 354 nt7.11□□□□□ -1.27
VFA1P40080 URA1YKL216W 945 nt7.11□□□□□ -1.27
VFA1P40080 YNL120CYNL120C 486 nt7.11□□□□□ -1.27
VFA1P40080 RFC4YOL094C 972 nt7.11□□□□□ -1.27
VFA1P40080 YPR204WYPR204W 3099 nt7.11□□□□□ -1.27
VFA1P40080 CRH1YGR189C 1524 nt7.11□□□□□ -1.27
VFA1P40080 PMT3YOR321W 2262 nt7.11□□□□□ -1.27
VFA1P40080 COX10YPL172C 1389 nt7.1□□□□□ -1.27
VFA1P40080 OGG1YML060W 1131 nt7.1□□□□□ -1.27
VFA1P40080 MSY1YPL097W 1479 nt7.1□□□□□ -1.27
VFA1P40080 SES1YDR023W 1389 nt7.09□□□□□ -1.27
VFA1P40080 SUF5tG(CCC)O 72 nt7.09□□□□□ -1.27
VFA1P40080 SQT1YIR012W 1296 nt7.09□□□□□ -1.27
VFA1P40080 HOC1YJR075W 1191 nt7.09□□□□□ -1.27
VFA1P40080 KSH1YNL024C-A 219 nt7.09□□□□□ -1.27
VFA1P40080 COX5AYNL052W 462 nt7.09□□□□□ -1.27
VFA1P40080 LSC1YOR142W 990 nt7.09□□□□□ -1.27
VFA1P40080 THI2YBR240C 1353 nt7.08□□□□□ -1.28
VFA1P40080 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.08□□□□□ -1.28
VFA1P40080 LIA1YJR070C 978 nt7.08□□□□□ -1.28
VFA1P40080 YHM2YMR241W 945 nt7.08□□□□□ -1.28
VFA1P40080 EDC3YEL015W 1656 nt7.08□□□□□ -1.28
VFA1P40080 UTR2YEL040W 1404 nt7.08□□□□□ -1.28
VFA1P40080 PLB3YOL011W 2061 nt7.07□□□□□ -1.28
VFA1P40080 RNH1YMR234W 1047 nt7.07□□□□□ -1.28
VFA1P40080 AAD14YNL331C 1131 nt7.07□□□□□ -1.28
VFA1P40080 ARG81YML099C 2643 nt7.06□□□□□ -1.28
VFA1P40080 RSP5YER125W 2430 nt7.06□□□□□ -1.28
VFA1P40080 YRB2YIL063C 984 nt7.06□□□□□ -1.28
VFA1P40080 PUS4YNL292W 1212 nt7.06□□□□□ -1.28
VFA1P40080 CIR2YOR356W 1896 nt7.05□□□□□ -1.28
VFA1P40080 RPP1YHR062C 882 nt7.05□□□□□ -1.28
VFA1P40080 YLR312CYLR312C 1197 nt7.05□□□□□ -1.28
VFA1P40080 YPL257WYPL257W 582 nt7.05□□□□□ -1.28
VFA1P40080 CYS4YGR155W 1524 nt7.05□□□□□ -1.28
VFA1P40080 YHK8YHR048W 1545 nt7.05□□□□□ -1.28
VFA1P40080 MRPL35YDR322W 1104 nt7.04□□□□□ -1.28
VFA1P40080 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.04□□□□□ -1.28
VFA1P40080 YAR064WYAR064W 300 nt7.04□□□□□ -1.28
VFA1P40080 AIM33YML087C 939 nt7.04□□□□□ -1.28
VFA1P40080 SGV1YPR161C 1974 nt7.03□□□□□ -1.28
VFA1P40080 GPD1YDL022W 1176 nt7.03□□□□□ -1.28
VFA1P40080 LCL3YGL085W 825 nt7.03□□□□□ -1.28
VFA1P40080 YLR123CYLR123C 330 nt7.03□□□□□ -1.28
VFA1P40080 EHD3YDR036C 1503 nt7.02□□□□□ -1.29
VFA1P40080 FAL1YDR021W 1200 nt7.02□□□□□ -1.29
VFA1P40080 ASF1YJL115W 840 nt7.02□□□□□ -1.29
VFA1P40080 PZF1YPR186C 1290 nt7.01□□□□□ -1.29
VFA1P40080 SKY1YMR216C 2229 nt7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.7 ms