Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 ECM30YLR436C 3825 nt6.7□□□□□ -1.34
CUE2P36075 YBL070CYBL070C 321 nt6.7□□□□□ -1.34
CUE2P36075 TOS6YNL300W 309 nt6.7□□□□□ -1.34
CUE2P36075 YPR204WYPR204W 3099 nt6.69□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 SOD2YHR008C 702 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 ERP2YAL007C 648 nt6.68□□□□□ -1.34
CUE2P36075 GTT3YEL017W 1014 nt6.67□□□□□ -1.34
CUE2P36075 YNR005CYNR005C 405 nt6.67□□□□□ -1.34
CUE2P36075 HEM1YDR232W 1647 nt6.67□□□□□ -1.34
CUE2P36075 CIA1YDR267C 993 nt6.66□□□□□ -1.34
CUE2P36075 URE2YNL229C 1065 nt6.66□□□□□ -1.34
CUE2P36075 HTZ1YOL012C 405 nt6.66□□□□□ -1.34
CUE2P36075 SES1YDR023W 1389 nt6.66□□□□□ -1.34
CUE2P36075 ARG81YML099C 2643 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE2P36075 MRPS28YDR337W 861 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE2P36075 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE2P36075 YPT1YFL038C 621 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE2P36075 COG1YGL223C 1254 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE2P36075 AIM33YML087C 939 nt6.65□□□□□ -1.34
CUE2P36075 FRE5YOR384W 2085 nt6.65□□□□□ -1.35
CUE2P36075 YKR023WYKR023W 1593 nt6.65□□□□□ -1.35
CUE2P36075 YHR020WYHR020W 2067 nt6.64□□□□□ -1.35
CUE2P36075 RIB1YBL033C 1038 nt6.64□□□□□ -1.35
CUE2P36075 COX5AYNL052W 462 nt6.64□□□□□ -1.35
CUE2P36075 YPL067CYPL067C 597 nt6.64□□□□□ -1.35
CUE2P36075 YTH1YPR107C 627 nt6.64□□□□□ -1.35
CUE2P36075 PDA1YER178W 1263 nt6.63□□□□□ -1.35
CUE2P36075 MPA43YNL249C 1629 nt6.63□□□□□ -1.35
CUE2P36075 PMT3YOR321W 2262 nt6.63□□□□□ -1.35
CUE2P36075 STT3YGL022W 2157 nt6.62□□□□□ -1.35
CUE2P36075 APE4YHR113W 1473 nt6.62□□□□□ -1.35
CUE2P36075 NMT1YLR195C 1368 nt6.62□□□□□ -1.35
CUE2P36075 PIH1YHR034C 1035 nt6.62□□□□□ -1.35
CUE2P36075 YPQ1YOL092W 927 nt6.62□□□□□ -1.35
CUE2P36075 SMX3YPR182W 261 nt6.62□□□□□ -1.35
CUE2P36075 PPM2YOL141W 2088 nt6.62□□□□□ -1.35
CUE2P36075 EHD3YDR036C 1503 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE2P36075 MKK1YOR231W 1527 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE2P36075 GFA1YKL104C 2154 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE2P36075 UME1YPL139C 1383 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE2P36075 TRR2YHR106W 1029 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE2P36075 YBR113WYBR113W 483 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE2P36075 snR30snR30 606 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE2P36075 YCL049CYCL049C 939 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE2P36075 HXT15YDL245C 1704 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE2P36075 HXT16YJR158W 1704 nt6.61□□□□□ -1.35
CUE2P36075 AI3Q0060 1248 nt6.6□□□□□ -1.35
CUE2P36075 YGL102CYGL102C 429 nt6.6□□□□□ -1.35
CUE2P36075 FBA1YKL060C 1080 nt6.6□□□□□ -1.35
CUE2P36075 EDE1YBL047C 4146 nt6.6□□□□□ -1.35
CUE2P36075 BNS1YGR230W 414 nt6.59□□□□□ -1.35
CUE2P36075 NAS6YGR232W 687 nt6.59□□□□□ -1.35
CUE2P36075 PRI1YIR008C 1230 nt6.59□□□□□ -1.35
CUE2P36075 ATG36YJL185C 882 nt6.59□□□□□ -1.35
CUE2P36075 UTR2YEL040W 1404 nt6.59□□□□□ -1.36
CUE2P36075 KNS1YLL019C 2214 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE2P36075 SLX5YDL013W 1860 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE2P36075 YUR1YJL139C 1287 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE2P36075 MIA40YKL195W 1212 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE2P36075 PTH2YBL057C 627 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE2P36075 PRS4YBL068W 981 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE2P36075 DFR1YOR236W 636 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE2P36075 MBF1YOR298C-A 456 nt6.58□□□□□ -1.36
CUE2P36075 HED1YDR014W-A 489 nt6.57□□□□□ -1.36
CUE2P36075 TMA46YOR091W 1038 nt6.57□□□□□ -1.36
CUE2P36075 SEC62YPL094C 825 nt6.57□□□□□ -1.36
CUE2P36075 ISC1YER019W 1434 nt6.57□□□□□ -1.36
CUE2P36075 HEM2YGL040C 1029 nt6.56□□□□□ -1.36
CUE2P36075 FZF1YGL254W 900 nt6.56□□□□□ -1.36
CUE2P36075 YOR343CYOR343C 327 nt6.56□□□□□ -1.36
CUE2P36075 ERG10YPL028W 1197 nt6.56□□□□□ -1.36
CUE2P36075 ATP4YPL078C 735 nt6.56□□□□□ -1.36
CUE2P36075 THI2YBR240C 1353 nt6.56□□□□□ -1.36
CUE2P36075 ICP55YER078C 1536 nt6.55□□□□□ -1.36
CUE2P36075 YFR006WYFR006W 1608 nt6.55□□□□□ -1.36
CUE2P36075 RPP1YHR062C 882 nt6.55□□□□□ -1.36
CUE2P36075 SQT1YIR012W 1296 nt6.55□□□□□ -1.36
CUE2P36075 COQ1YBR003W 1422 nt6.55□□□□□ -1.36
CUE2P36075 ATF1YOR377W 1578 nt6.54□□□□□ -1.36
CUE2P36075 MSC3YLR219W 2187 nt6.54□□□□□ -1.36
CUE2P36075 HDA1YNL021W 2121 nt6.53□□□□□ -1.36
CUE2P36075 AVT4YNL101W 2142 nt6.53□□□□□ -1.36
CUE2P36075 CCC2YDR270W 3015 nt6.53□□□□□ -1.36
CUE2P36075 LSM12YHR121W 564 nt6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73.6 ms