Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 YKR023WYKR023W 1593 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 GCN3YKR026C 918 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 SWD1YAR003W 1281 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 AAD14YNL331C 1131 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 COX15YER141W 1461 nt6.97□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 VTS1YOR359W 1572 nt6.96□□□□□ -1.29
YBL055CP34220 COQ1YBR003W 1422 nt6.96□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 TOS6YNL300W 309 nt6.96□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 EMP65YER140W 1671 nt6.96□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 ERG12YMR208W 1332 nt6.96□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 ATG36YJL185C 882 nt6.95□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 ACO1YLR304C 2337 nt6.95□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 HIS1YER055C 894 nt6.94□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YJR107WYJR107W 987 nt6.94□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YKL077WYKL077W 1179 nt6.94□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YNL092WYNL092W 1203 nt6.94□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YTH1YPR107C 627 nt6.94□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YCR061WYCR061W 1896 nt6.94□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 PLB3YOL011W 2061 nt6.93□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 FMP40YPL222W 2067 nt6.93□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YJL144WYJL144W 315 nt6.93□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 HOC1YJR075W 1191 nt6.93□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 PUS4YNL292W 1212 nt6.93□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 ADH5YBR145W 1056 nt6.93□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 HDA1YNL021W 2121 nt6.92□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YDR415CYDR415C 1125 nt6.92□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 FPR2YDR519W 408 nt6.92□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 DFR1YOR236W 636 nt6.92□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 CMK2YOL016C 1344 nt6.92□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 CRH1YGR189C 1524 nt6.91□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 ATG22YCL038C 1587 nt6.91□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 HEM1YDR232W 1647 nt6.91□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YPT1YFL038C 621 nt6.91□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 LIA1YJR070C 978 nt6.91□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 EDE1YBL047C 4146 nt6.91□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 SGV1YPR161C 1974 nt6.9□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YKL102CYKL102C 306 nt6.9□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 MIA40YKL195W 1212 nt6.9□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YKR032WYKR032W 315 nt6.9□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 ECM30YLR436C 3825 nt6.9□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 CUE4YML101C 354 nt6.9□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 MRPL23YOR150W 492 nt6.9□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 YBR113WYBR113W 483 nt6.9□□□□□ -1.3
YBL055CP34220 GLN3YER040W 2193 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 HEM2YGL040C 1029 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 IDP3YNL009W 1263 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 RFC4YOL094C 972 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 COX10YPL172C 1389 nt6.89□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 CYS4YGR155W 1524 nt6.88□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 PHO3YBR092C 1404 nt6.88□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 BIM1YER016W 1035 nt6.88□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 DID2YKR035W-A 615 nt6.88□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 DPH5YLR172C 903 nt6.88□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 LSC1YOR142W 990 nt6.88□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 DAL7YIR031C 1665 nt6.87□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 GPD1YDL022W 1176 nt6.87□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 RNH1YMR234W 1047 nt6.87□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 YOR300WYOR300W 309 nt6.87□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 HAL5YJL165C 2568 nt6.86□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 MRPL35YDR322W 1104 nt6.86□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 GTT3YEL017W 1014 nt6.86□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 YJR146WYJR146W 354 nt6.86□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 FBA1YKL060C 1080 nt6.86□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.86□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 HEL1YKR017C 1656 nt6.85□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 ASF1YJL115W 840 nt6.85□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 YNL120CYNL120C 486 nt6.85□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 YHK8YHR048W 1545 nt6.85□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 LCL3YGL085W 825 nt6.84□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 YRB2YIL063C 984 nt6.84□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 KSH1YNL024C-A 219 nt6.84□□□□□ -1.31
YBL055CP34220 PMT3YOR321W 2262 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 FMO1YHR176W 1299 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 YAR064WYAR064W 300 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 OGG1YML060W 1131 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 TOS2YGR221C 1869 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 CIR2YOR356W 1896 nt6.83□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 THI2YBR240C 1353 nt6.82□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 YPR204WYPR204W 3099 nt6.82□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 MSY1YPL097W 1479 nt6.82□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.82□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 PUS5YLR165C 765 nt6.82□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 AIM33YML087C 939 nt6.82□□□□□ -1.32
YBL055CP34220 KDX1YKL161C 1302 nt6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.1 ms