Protein–RNA interactions for Protein: P25582

SPB1, 27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPB1P25582 PPH22YDL188C 1134 nt6.66□□□□□ -1.34
SPB1P25582 GTT3YEL017W 1014 nt6.66□□□□□ -1.34
SPB1P25582 RTC4YNL254C 1206 nt6.66□□□□□ -1.34
SPB1P25582 RPL5YPL131W 894 nt6.66□□□□□ -1.34
SPB1P25582 ARP3YJR065C 1350 nt6.66□□□□□ -1.34
SPB1P25582 PUS5YLR165C 765 nt6.65□□□□□ -1.34
SPB1P25582 SUR7YML052W 909 nt6.65□□□□□ -1.34
SPB1P25582 YPR130CYPR130C 408 nt6.65□□□□□ -1.34
SPB1P25582 snR30snR30 606 nt6.65□□□□□ -1.34
SPB1P25582 DYS1YHR068W 1164 nt6.64□□□□□ -1.35
SPB1P25582 MPE1YKL059C 1326 nt6.64□□□□□ -1.35
SPB1P25582 PEX31YGR004W 1389 nt6.64□□□□□ -1.35
SPB1P25582 TRS31YDR472W 852 nt6.63□□□□□ -1.35
SPB1P25582 ERP2YAL007C 648 nt6.63□□□□□ -1.35
SPB1P25582 URA1YKL216W 945 nt6.63□□□□□ -1.35
SPB1P25582 NAF1YNL124W 1479 nt6.62□□□□□ -1.35
SPB1P25582 GET4YOR164C 939 nt6.62□□□□□ -1.35
SPB1P25582 GAA1YLR088W 1845 nt6.62□□□□□ -1.35
SPB1P25582 FRE5YOR384W 2085 nt6.61□□□□□ -1.35
SPB1P25582 FPR2YDR519W 408 nt6.61□□□□□ -1.35
SPB1P25582 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.61□□□□□ -1.35
SPB1P25582 FHN1YGR131W 525 nt6.61□□□□□ -1.35
SPB1P25582 ZIM17YNL310C 525 nt6.61□□□□□ -1.35
SPB1P25582 YLR162WYLR162W 357 nt6.6□□□□□ -1.35
SPB1P25582 PLB2YMR006C 2121 nt6.59□□□□□ -1.35
SPB1P25582 CIA1YDR267C 993 nt6.59□□□□□ -1.35
SPB1P25582 YBL070CYBL070C 321 nt6.59□□□□□ -1.35
SPB1P25582 MCP1YOR228C 909 nt6.59□□□□□ -1.35
SPB1P25582 HXT2YMR011W 1626 nt6.58□□□□□ -1.36
SPB1P25582 URH1YDR400W 1023 nt6.58□□□□□ -1.36
SPB1P25582 YCL049CYCL049C 939 nt6.58□□□□□ -1.36
SPB1P25582 MIP1YOR330C 3765 nt6.58□□□□□ -1.36
SPB1P25582 FCY22YER060W-A 1593 nt6.57□□□□□ -1.36
SPB1P25582 CBR1YIL043C 855 nt6.57□□□□□ -1.36
SPB1P25582 CSM2YIL132C 642 nt6.57□□□□□ -1.36
SPB1P25582 GCN3YKR026C 918 nt6.57□□□□□ -1.36
SPB1P25582 LGE1YPL055C 999 nt6.57□□□□□ -1.36
SPB1P25582 SPE3YPR069C 882 nt6.57□□□□□ -1.36
SPB1P25582 JIP4YDR475C 2631 nt6.57□□□□□ -1.36
SPB1P25582 ELP3YPL086C 1674 nt6.56□□□□□ -1.36
SPB1P25582 YJL144WYJL144W 315 nt6.56□□□□□ -1.36
SPB1P25582 SPG5YMR191W 1122 nt6.56□□□□□ -1.36
SPB1P25582 ADH5YBR145W 1056 nt6.56□□□□□ -1.36
SPB1P25582 YBR284WYBR284W 2394 nt6.55□□□□□ -1.36
SPB1P25582 GLN3YER040W 2193 nt6.55□□□□□ -1.36
SPB1P25582 HIS1YER055C 894 nt6.55□□□□□ -1.36
SPB1P25582 YJR107WYJR107W 987 nt6.55□□□□□ -1.36
SPB1P25582 SML1YML058W 315 nt6.55□□□□□ -1.36
SPB1P25582 CUE4YML101C 354 nt6.55□□□□□ -1.36
SPB1P25582 PHO3YBR092C 1404 nt6.55□□□□□ -1.36
SPB1P25582 NMT1YLR195C 1368 nt6.55□□□□□ -1.36
SPB1P25582 BRN1YBL097W 2265 nt6.55□□□□□ -1.36
SPB1P25582 SLX5YDL013W 1860 nt6.54□□□□□ -1.36
SPB1P25582 REC107YJR021C 945 nt6.54□□□□□ -1.36
SPB1P25582 RPL31BYLR406C 342 nt6.54□□□□□ -1.36
SPB1P25582 HTZ1YOL012C 405 nt6.54□□□□□ -1.36
SPB1P25582 TFC6YDR362C 2019 nt6.54□□□□□ -1.36
SPB1P25582 YDL177CYDL177C 513 nt6.53□□□□□ -1.36
SPB1P25582 YSC83YHR017W 1158 nt6.53□□□□□ -1.36
SPB1P25582 CDC11YJR076C 1248 nt6.53□□□□□ -1.36
SPB1P25582 YNR005CYNR005C 405 nt6.53□□□□□ -1.36
SPB1P25582 YPR204WYPR204W 3099 nt6.53□□□□□ -1.36
SPB1P25582 TOS6YNL300W 309 nt6.52□□□□□ -1.37
SPB1P25582 AAD14YNL331C 1131 nt6.52□□□□□ -1.37
SPB1P25582 NTG2YOL043C 1143 nt6.52□□□□□ -1.37
SPB1P25582 IRC11YOR013W 471 nt6.52□□□□□ -1.37
SPB1P25582 HST2YPL015C 1074 nt6.52□□□□□ -1.37
SPB1P25582 YKR032WYKR032W 315 nt6.51□□□□□ -1.37
SPB1P25582 MSN2YMR037C 2115 nt6.51□□□□□ -1.37
SPB1P25582 CYC8YBR112C 2901 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 YDR415CYDR415C 1125 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 PTC7YHR076W 1032 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 YNL165WYNL165W 1221 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 YNL200CYNL200C 741 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 ARG81YML099C 2643 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 YMR034CYMR034C 1305 nt6.5□□□□□ -1.37
SPB1P25582 YJL163CYJL163C 1668 nt6.49□□□□□ -1.37
SPB1P25582 GUF1YLR289W 1938 nt6.49□□□□□ -1.37
SPB1P25582 LDB7YBL006C 543 nt6.49□□□□□ -1.37
SPB1P25582 PUS4YNL292W 1212 nt6.49□□□□□ -1.37
SPB1P25582 ERG10YPL028W 1197 nt6.49□□□□□ -1.37
SPB1P25582 PLB3YOL011W 2061 nt6.49□□□□□ -1.37
SPB1P25582 BIO3YNR058W 1443 nt6.49□□□□□ -1.37
SPB1P25582 PAP2YOL115W 1755 nt6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 155.1 ms