Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd12P23812 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd12P23812 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxd12P23812 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxd12P23812 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms