Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
Hoxd12P23812 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Hoxd12P23812 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Hoxd12P23812 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Hoxd12P23812 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Hoxd12P23812 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Hoxd12P23812 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Hoxd12P23812 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Hoxd12P23812 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Hoxd12P23812 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Hoxd12P23812 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Hoxd12P23812 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Hoxd12P23812 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Hoxd12P23812 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Hoxd12P23812 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hoxd12P23812 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hoxd12P23812 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Hoxd12P23812 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hoxd12P23812 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hoxd12P23812 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hoxd12P23812 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hoxd12P23812 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hoxd12P23812 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hoxd12P23812 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Hoxd12P23812 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Hoxd12P23812 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Hoxd12P23812 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Hoxd12P23812 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxd12P23812 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxd12P23812 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxd12P23812 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hoxd12P23812 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Hoxd12P23812 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Hoxd12P23812 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Hoxd12P23812 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxd12P23812 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Hoxd12P23812 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Hoxd12P23812 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Hoxd12P23812 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Hoxd12P23812 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Hoxd12P23812 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Hoxd12P23812 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Hoxd12P23812 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Hoxd12P23812 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Hoxd12P23812 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hoxd12P23812 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Hoxd12P23812 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Hoxd12P23812 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Hoxd12P23812 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Hoxd12P23812 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Hoxd12P23812 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Hoxd12P23812 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Hoxd12P23812 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Hoxd12P23812 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Hoxd12P23812 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Hoxd12P23812 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Hoxd12P23812 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Hoxd12P23812 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hoxd12P23812 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Hoxd12P23812 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Hoxd12P23812 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Hoxd12P23812 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Hoxd12P23812 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hoxd12P23812 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hoxd12P23812 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hoxd12P23812 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Hoxd12P23812 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hoxd12P23812 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hoxd12P23812 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hoxd12P23812 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hoxd12P23812 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hoxd12P23812 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hoxd12P23812 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hoxd12P23812 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Hoxd12P23812 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Hoxd12P23812 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hoxd12P23812 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hoxd12P23812 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hoxd12P23812 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hoxd12P23812 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hoxd12P23812 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Hoxd12P23812 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxd12P23812 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxd12P23812 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxd12P23812 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxd12P23812 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxd12P23812 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxd12P23812 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxd12P23812 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxd12P23812 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxd12P23812 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxd12P23812 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxd12P23812 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hoxd12P23812 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Hoxd12P23812 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxd12P23812 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxd12P23812 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxd12P23812 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxd12P23812 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxd12P23812 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms