Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PenkP22005 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PenkP22005 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PenkP22005 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PenkP22005 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PenkP22005 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PenkP22005 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PenkP22005 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PenkP22005 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PenkP22005 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PenkP22005 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PenkP22005 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PenkP22005 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PenkP22005 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PenkP22005 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PenkP22005 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PenkP22005 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PenkP22005 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PenkP22005 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PenkP22005 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PenkP22005 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PenkP22005 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PenkP22005 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PenkP22005 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PenkP22005 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PenkP22005 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PenkP22005 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PenkP22005 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PenkP22005 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PenkP22005 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PenkP22005 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PenkP22005 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PenkP22005 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PenkP22005 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PenkP22005 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PenkP22005 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PenkP22005 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PenkP22005 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PenkP22005 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PenkP22005 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PenkP22005 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PenkP22005 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PenkP22005 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PenkP22005 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PenkP22005 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PenkP22005 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PenkP22005 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PenkP22005 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PenkP22005 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PenkP22005 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PenkP22005 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PenkP22005 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PenkP22005 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PenkP22005 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PenkP22005 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PenkP22005 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PenkP22005 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PenkP22005 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PenkP22005 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PenkP22005 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PenkP22005 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PenkP22005 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PenkP22005 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PenkP22005 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PenkP22005 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PenkP22005 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PenkP22005 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PenkP22005 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PenkP22005 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PenkP22005 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PenkP22005 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PenkP22005 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PenkP22005 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PenkP22005 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PenkP22005 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PenkP22005 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PenkP22005 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PenkP22005 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PenkP22005 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PenkP22005 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PenkP22005 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PenkP22005 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PenkP22005 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PenkP22005 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PenkP22005 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PenkP22005 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PenkP22005 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PenkP22005 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PenkP22005 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PenkP22005 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PenkP22005 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PenkP22005 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PenkP22005 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PenkP22005 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PenkP22005 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PenkP22005 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PenkP22005 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PenkP22005 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PenkP22005 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PenkP22005 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms