Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dll3O88516 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dll3O88516 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dll3O88516 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dll3O88516 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dll3O88516 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dll3O88516 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dll3O88516 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dll3O88516 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dll3O88516 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dll3O88516 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dll3O88516 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dll3O88516 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dll3O88516 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dll3O88516 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms