Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dsg3O35902 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dsg3O35902 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dsg3O35902 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dsg3O35902 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms