Protein–RNA interactions for Protein: O35386

Phyh, Phytanoyl-CoA dioxygenase, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhyhO35386 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PhyhO35386 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PhyhO35386 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhyhO35386 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PhyhO35386 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PhyhO35386 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PhyhO35386 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PhyhO35386 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PhyhO35386 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PhyhO35386 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PhyhO35386 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PhyhO35386 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PhyhO35386 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PhyhO35386 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PhyhO35386 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms