Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34aG3UW52 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34aG3UW52 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34aG3UW52 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn34aG3UW52 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn34aG3UW52 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34aG3UW52 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34aG3UW52 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34aG3UW52 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34aG3UW52 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn34aG3UW52 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34aG3UW52 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms