Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Svep1A2AVA0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Svep1A2AVA0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Svep1A2AVA0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Svep1A2AVA0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Svep1A2AVA0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Svep1A2AVA0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Svep1A2AVA0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Svep1A2AVA0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Svep1A2AVA0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Svep1A2AVA0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Svep1A2AVA0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Svep1A2AVA0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Svep1A2AVA0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Svep1A2AVA0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Svep1A2AVA0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms