Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SEC24CP53992 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SEC24CP53992 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms