Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Opn4Q9QXZ9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Opn4Q9QXZ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Opn4Q9QXZ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opn4Q9QXZ9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms