Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlr4Q9QUK6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr4Q9QUK6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr4Q9QUK6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr4Q9QUK6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms