Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Irx5Q9JKQ4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Irx5Q9JKQ4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Irx5Q9JKQ4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Irx5Q9JKQ4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Irx5Q9JKQ4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms