Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tmod2Q9JKK7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmod2Q9JKK7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tmod2Q9JKK7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tmod2Q9JKK7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmod2Q9JKK7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms