Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
3100002H09RikQ9CXW6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
3100002H09RikQ9CXW6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
3100002H09RikQ9CXW6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms