Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmed5Q9CXE7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmed5Q9CXE7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmed5Q9CXE7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmed5Q9CXE7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmed5Q9CXE7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms