Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Crb1Q8VHS2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Crb1Q8VHS2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Crb1Q8VHS2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Crb1Q8VHS2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Crb1Q8VHS2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms