Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCB2

Med25, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 25, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med25Q8VCB2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Med25Q8VCB2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med25Q8VCB2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Med25Q8VCB2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med25Q8VCB2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med25Q8VCB2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med25Q8VCB2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med25Q8VCB2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Med25Q8VCB2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Med25Q8VCB2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med25Q8VCB2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med25Q8VCB2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med25Q8VCB2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med25Q8VCB2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med25Q8VCB2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med25Q8VCB2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med25Q8VCB2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Med25Q8VCB2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Med25Q8VCB2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med25Q8VCB2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med25Q8VCB2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms