Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FgbQ8K0E8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FgbQ8K0E8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FgbQ8K0E8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms