Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubqln3Q8C5U9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Ubqln3Q8C5U9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ubqln3Q8C5U9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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