Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Ubqln3Q8C5U9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ubqln3Q8C5U9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ubqln3Q8C5U9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ubqln3Q8C5U9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ubqln3Q8C5U9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ubqln3Q8C5U9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubqln3Q8C5U9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubqln3Q8C5U9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubqln3Q8C5U9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubqln3Q8C5U9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubqln3Q8C5U9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ubqln3Q8C5U9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ubqln3Q8C5U9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubqln3Q8C5U9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubqln3Q8C5U9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ubqln3Q8C5U9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ubqln3Q8C5U9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubqln3Q8C5U9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ubqln3Q8C5U9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ubqln3Q8C5U9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ubqln3Q8C5U9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ubqln3Q8C5U9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubqln3Q8C5U9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ubqln3Q8C5U9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ubqln3Q8C5U9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ubqln3Q8C5U9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ubqln3Q8C5U9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubqln3Q8C5U9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubqln3Q8C5U9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubqln3Q8C5U9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ubqln3Q8C5U9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ubqln3Q8C5U9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubqln3Q8C5U9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubqln3Q8C5U9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ubqln3Q8C5U9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubqln3Q8C5U9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubqln3Q8C5U9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubqln3Q8C5U9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ubqln3Q8C5U9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubqln3Q8C5U9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubqln3Q8C5U9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubqln3Q8C5U9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubqln3Q8C5U9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubqln3Q8C5U9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubqln3Q8C5U9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubqln3Q8C5U9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubqln3Q8C5U9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubqln3Q8C5U9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubqln3Q8C5U9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubqln3Q8C5U9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubqln3Q8C5U9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubqln3Q8C5U9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubqln3Q8C5U9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubqln3Q8C5U9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubqln3Q8C5U9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubqln3Q8C5U9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubqln3Q8C5U9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubqln3Q8C5U9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubqln3Q8C5U9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubqln3Q8C5U9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubqln3Q8C5U9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubqln3Q8C5U9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubqln3Q8C5U9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubqln3Q8C5U9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubqln3Q8C5U9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubqln3Q8C5U9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubqln3Q8C5U9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubqln3Q8C5U9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubqln3Q8C5U9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubqln3Q8C5U9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubqln3Q8C5U9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubqln3Q8C5U9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubqln3Q8C5U9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubqln3Q8C5U9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubqln3Q8C5U9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubqln3Q8C5U9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubqln3Q8C5U9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubqln3Q8C5U9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubqln3Q8C5U9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubqln3Q8C5U9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubqln3Q8C5U9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubqln3Q8C5U9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubqln3Q8C5U9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubqln3Q8C5U9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubqln3Q8C5U9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubqln3Q8C5U9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ubqln3Q8C5U9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ubqln3Q8C5U9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ubqln3Q8C5U9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ubqln3Q8C5U9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ubqln3Q8C5U9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ubqln3Q8C5U9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubqln3Q8C5U9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ubqln3Q8C5U9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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