Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nudcd1Q6PIP5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nudcd1Q6PIP5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nudcd1Q6PIP5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms