Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfrlQ6PE55 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfrlQ6PE55 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PdgfrlQ6PE55 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PdgfrlQ6PE55 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfrlQ6PE55 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfrlQ6PE55 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms