Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Smchd1Q6P5D8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smchd1Q6P5D8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smchd1Q6P5D8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Smchd1Q6P5D8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smchd1Q6P5D8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
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