Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Top2bQ64511 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Top2bQ64511 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
Top2bQ64511 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Top2bQ64511 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Top2bQ64511 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Top2bQ64511 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Top2bQ64511 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms