Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Col4a5Q63ZW6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Col4a5Q63ZW6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col4a5Q63ZW6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Col4a5Q63ZW6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col4a5Q63ZW6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col4a5Q63ZW6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms