Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eri2Q5BKS4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Eri2Q5BKS4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eri2Q5BKS4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eri2Q5BKS4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eri2Q5BKS4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Eri2Q5BKS4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eri2Q5BKS4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eri2Q5BKS4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eri2Q5BKS4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eri2Q5BKS4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Eri2Q5BKS4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Eri2Q5BKS4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Eri2Q5BKS4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms