Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Clpsl2Q3UW21 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clpsl2Q3UW21 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clpsl2Q3UW21 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clpsl2Q3UW21 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clpsl2Q3UW21 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Clpsl2Q3UW21 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clpsl2Q3UW21 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Clpsl2Q3UW21 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clpsl2Q3UW21 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clpsl2Q3UW21 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Clpsl2Q3UW21 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Clpsl2Q3UW21 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Clpsl2Q3UW21 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms