Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7B9

YOR008C-A, Uncharacterized protein YOR008C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR008C-AQ3E7B9 ERG10YPL028W 1197 nt5.03□□□□□ -1.6
YOR008C-AQ3E7B9 YPR204WYPR204W 3099 nt5.03□□□□□ -1.6
YOR008C-AQ3E7B9 ADE2YOR128C 1716 nt5.03□□□□□ -1.6
YOR008C-AQ3E7B9 MIP1YOR330C 3765 nt5.02□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 NAF1YNL124W 1479 nt5.02□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 PLB2YMR006C 2121 nt5.02□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 COX5AYNL052W 462 nt5.02□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 BRN1YBL097W 2265 nt5.02□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 CMK2YOL016C 1344 nt5.01□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 ISC1YER019W 1434 nt5.01□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 DML1YMR211W 1428 nt5.01□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 PMT3YOR321W 2262 nt5.01□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 YPT1YFL038C 621 nt5.01□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 CBR1YIL043C 855 nt5.01□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 REC107YJR021C 945 nt5.01□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 GET4YOR164C 939 nt5.01□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 SUF16tG(GCC)C 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 DOC1YGL240W 753 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 NCA3YJL116C 1014 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 YNL200CYNL200C 741 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 YBR113WYBR113W 483 nt5□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 RPL31BYLR406C 342 nt4.99□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 NTG2YOL043C 1143 nt4.99□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 YHR020WYHR020W 2067 nt4.99□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 HEM1YDR232W 1647 nt4.98□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 MRPS28YDR337W 861 nt4.98□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 ATG36YJL185C 882 nt4.98□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 MIA40YKL195W 1212 nt4.98□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 PUP1YOR157C 786 nt4.98□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 NOG2YNR053C 1461 nt4.98□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 YCR061WYCR061W 1896 nt4.98□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 ARG81YML099C 2643 nt4.97□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 PPM2YOL141W 2088 nt4.97□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 TMA46YOR091W 1038 nt4.97□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 TKL2YBR117C 2046 nt4.97□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 CEF1YMR213W 1773 nt4.96□□□□□ -1.61
YOR008C-AQ3E7B9 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt4.96□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 YNR005CYNR005C 405 nt4.96□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 HTZ1YOL012C 405 nt4.96□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 AVT4YNL101W 2142 nt4.96□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 EDE1YBL047C 4146 nt4.95□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 TOS1YBR162C 1368 nt4.95□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 FBA1YKL060C 1080 nt4.95□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 FUS3YBL016W 1062 nt4.95□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 YIP4YGL198W 708 nt4.94□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 RPP1YHR062C 882 nt4.94□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 DFR1YOR236W 636 nt4.94□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 UTR2YEL040W 1404 nt4.94□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 PDR18YNR070W 4002 nt4.94□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 RIO1YOR119C 1455 nt4.94□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 THI2YBR240C 1353 nt4.93□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 STT3YGL022W 2157 nt4.93□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 YPR130CYPR130C 408 nt4.93□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 SMX3YPR182W 261 nt4.93□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 APE4YHR113W 1473 nt4.93□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 YML133CYML133C 4125 nt4.93□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 PEX3YDR329C 1326 nt4.93□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 RSC4YKR008W 1878 nt4.92□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 VMA2YBR127C 1554 nt4.92□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 YGL102CYGL102C 429 nt4.92□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 HSM3YBR272C 1443 nt4.91□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 CIA1YDR267C 993 nt4.91□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 YIA6YIL006W 1122 nt4.91□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 PRI1YIR008C 1230 nt4.91□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 ICS3YJL077C 396 nt4.91□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 SWD1YAR003W 1281 nt4.91□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 KSH1YNL024C-A 219 nt4.91□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt4.91□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 CRP1YHR146W 1398 nt4.91□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 TOS2YGR221C 1869 nt4.9□□□□□ -1.62
YOR008C-AQ3E7B9 DMA1YHR115C 1251 nt4.9□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 SQT1YIR012W 1296 nt4.9□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 PEX13YLR191W 1161 nt4.9□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 YLR358CYLR358C 564 nt4.9□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 COX10YPL172C 1389 nt4.9□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 COQ1YBR003W 1422 nt4.89□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 RAP1YNL216W 2484 nt4.89□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt4.89□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt4.89□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt4.89□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 SUP51tL(UAA)J 84 nt4.89□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt4.89□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt4.89□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt4.89□□□□□ -1.63
YOR008C-AQ3E7B9 CIS3YJL158C 684 nt4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.5 ms