Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 CHA1YCL064C 1083 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 LCL3YGL085W 825 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 PRI1YIR008C 1230 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 YLL056CYLL056C 897 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 LOT6YLR011W 576 nt6.96□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 CTF3YLR381W 2202 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 RPL31BYLR406C 342 nt6.95□□□□□ -1.3 RIP-Chip
PUF2Q12221 MRPL19YNL185C 477 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 SMX3YPR182W 261 nt6.95□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 MIX17YMR002W 471 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 TOD6YBL054W 1578 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 TDP1YBR223C 1635 nt6.94□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 FCP1YMR277W 2199 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 VBA5YKR105C 1749 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 MRPS28YDR337W 861 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 PTC7YHR076W 1032 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 AIM20YIL158W 615 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 ILV6YCL009C 930 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 NUP84YDL116W 2181 nt6.93□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 SEC62YPL094C 825 nt6.92□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 YBR113WYBR113W 483 nt6.91□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 YKL102CYKL102C 306 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 YKL153WYKL153W 510 nt6.9□□□□□ -1.3
PUF2Q12221 AFG2YLR397C 2343 nt6.9□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 SAL1YNL083W 1485 nt6.9□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 YIL108WYIL108W 2091 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 CBR1YIL043C 855 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 ASF1YJL115W 840 nt6.89□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 CEM1YER061C 1329 nt6.88□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 YER137CYER137C 447 nt6.88□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 SNF4YGL115W 969 nt6.88□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 SCS22YBL091C-A 528 nt6.88□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 DOT1YDR440W 1749 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 COG1YGL223C 1254 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 YKL077WYKL077W 1179 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 YBL112CYBL112C 318 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 CMK2YOL016C 1344 nt6.86□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF2Q12221 YCR041WYCR041W 333 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 HED1YDR014W-A 489 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 OPI7YDR360W 435 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 URH1YDR400W 1023 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 FMO1YHR176W 1299 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 TAF9YMR236W 474 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 UBP13YBL067C 2244 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 RBS1YDL189W 1374 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 TRS31YDR472W 852 nt6.85□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF2Q12221 MDH1YKL085W 1005 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 YNL092WYNL092W 1203 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 MRPS18YNL306W 654 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 SNT309YPR101W 528 nt6.85□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF2Q12221 TUF1YOR187W 1314 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 IMG1YCR046C 510 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 YLR112WYLR112W 420 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 YMR253CYMR253C 1245 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 YOR012WYOR012W 414 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF2Q12221 ERR1YOR393W 1314 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 ERR2YPL281C 1314 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 GAL83YER027C 1254 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 MSB3YNL293W 1902 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 MRPL28YDR462W 444 nt6.82□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.82□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 SWD1YAR003W 1281 nt6.82□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 AMN1YBR158W 1650 nt6.81□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF2Q12221 GCG1YER163C 699 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 ATP10YLR393W 840 nt6.81□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR252CYMR252C 405 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 MRPL23YOR150W 492 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 PAC2YER007W 1557 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 HXT13YEL069C 1695 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 YSC83YHR017W 1158 nt6.8□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 POR2YIL114C 846 nt6.8□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 YTH1YPR107C 627 nt6.8□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR034CYMR034C 1305 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 YLR184WYLR184W 348 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 BNA3YJL060W 1335 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 YKR045CYKR045C 552 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 TSR2YLR435W 618 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 RNH1YMR234W 1047 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 TMA46YOR091W 1038 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 HEL1YKR017C 1656 nt6.77□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 POB3YML069W 1659 nt6.77□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 GPD2YOL059W 1323 nt6.77□□□□□ -1.32
PUF2Q12221 COQ1YBR003W 1422 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 YDL177CYDL177C 513 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 FAF1YIL019W 1041 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 AIM2YAL049C 741 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 YHR020WYHR020W 2067 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 MTR3YGR158C 753 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 CUE4YML101C 354 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 YPL136WYPL136W 369 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 ERG8YMR220W 1356 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 YNL040WYNL040W 1371 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 ERS1YCR075C 783 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 RGD2YFL047W 2145 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 OM45YIL136W 1182 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF2Q12221 DRE2YKR071C 1047 nt6.75□□□□□ -1.33
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