Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 IRC5YFR038W 2562 nt5.97□□□□□ -1.45
USB1Q12208 YLR162WYLR162W 357 nt5.97□□□□□ -1.45
USB1Q12208 YOL099CYOL099C 492 nt5.97□□□□□ -1.45
USB1Q12208 YOR012WYOR012W 414 nt5.97□□□□□ -1.45
USB1Q12208 snR30snR30 606 nt5.97□□□□□ -1.45
USB1Q12208 AMN1YBR158W 1650 nt5.97□□□□□ -1.45
USB1Q12208 MSG5YNL053W 1470 nt5.96□□□□□ -1.45
USB1Q12208 FET4YMR319C 1659 nt5.96□□□□□ -1.46
USB1Q12208 PAC10YGR078C 600 nt5.96□□□□□ -1.46
USB1Q12208 AAD14YNL331C 1131 nt5.96□□□□□ -1.46
USB1Q12208 CTA1YDR256C 1548 nt5.95□□□□□ -1.46
USB1Q12208 QCR6YFR033C 444 nt5.95□□□□□ -1.46
USB1Q12208 CYS3YAL012W 1185 nt5.95□□□□□ -1.46
USB1Q12208 MCH2YKL221W 1422 nt5.95□□□□□ -1.46
USB1Q12208 NTG2YOL043C 1143 nt5.95□□□□□ -1.46
USB1Q12208 YCL049CYCL049C 939 nt5.95□□□□□ -1.46
USB1Q12208 FRE5YOR384W 2085 nt5.95□□□□□ -1.46
USB1Q12208 APE4YHR113W 1473 nt5.95□□□□□ -1.46
USB1Q12208 SGV1YPR161C 1974 nt5.95□□□□□ -1.46
USB1Q12208 PDA1YER178W 1263 nt5.93□□□□□ -1.46
USB1Q12208 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt5.93□□□□□ -1.46
USB1Q12208 PTC7YHR076W 1032 nt5.93□□□□□ -1.46
USB1Q12208 ARC35YNR035C 1029 nt5.93□□□□□ -1.46
USB1Q12208 YJL144WYJL144W 315 nt5.92□□□□□ -1.46
USB1Q12208 MCP1YOR228C 909 nt5.92□□□□□ -1.46
USB1Q12208 RBS1YDL189W 1374 nt5.92□□□□□ -1.46
USB1Q12208 GYP8YFL027C 1494 nt5.91□□□□□ -1.46
USB1Q12208 MRPL28YDR462W 444 nt5.91□□□□□ -1.46
USB1Q12208 SML1YML058W 315 nt5.91□□□□□ -1.46
USB1Q12208 YKR023WYKR023W 1593 nt5.91□□□□□ -1.46
USB1Q12208 YMR034CYMR034C 1305 nt5.91□□□□□ -1.46
USB1Q12208 MRPL19YNL185C 477 nt5.9□□□□□ -1.46
USB1Q12208 YOR300WYOR300W 309 nt5.9□□□□□ -1.46
USB1Q12208 ERG10YPL028W 1197 nt5.9□□□□□ -1.46
USB1Q12208 YPR076WYPR076W 375 nt5.9□□□□□ -1.46
USB1Q12208 CEM1YER061C 1329 nt5.9□□□□□ -1.47
USB1Q12208 ERG12YMR208W 1332 nt5.9□□□□□ -1.47
USB1Q12208 TUF1YOR187W 1314 nt5.9□□□□□ -1.47
USB1Q12208 YJL163CYJL163C 1668 nt5.89□□□□□ -1.47
USB1Q12208 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.89□□□□□ -1.47
USB1Q12208 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.89□□□□□ -1.47
USB1Q12208 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.89□□□□□ -1.47
USB1Q12208 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.89□□□□□ -1.47
USB1Q12208 FIT2YOR382W 462 nt5.89□□□□□ -1.47
USB1Q12208 HDA1YNL021W 2121 nt5.89□□□□□ -1.47
USB1Q12208 ERS1YCR075C 783 nt5.88□□□□□ -1.47
USB1Q12208 HHY1YEL059W 309 nt5.88□□□□□ -1.47
USB1Q12208 YGL102CYGL102C 429 nt5.88□□□□□ -1.47
USB1Q12208 REC107YJR021C 945 nt5.88□□□□□ -1.47
USB1Q12208 YLL056CYLL056C 897 nt5.88□□□□□ -1.47
USB1Q12208 SPG5YMR191W 1122 nt5.88□□□□□ -1.47
USB1Q12208 TAH11YJR046W 1815 nt5.88□□□□□ -1.47
USB1Q12208 TRR1YDR353W 960 nt5.87□□□□□ -1.47
USB1Q12208 ZIM17YNL310C 525 nt5.87□□□□□ -1.47
USB1Q12208 LGE1YPL055C 999 nt5.87□□□□□ -1.47
USB1Q12208 HBN1YCL026C-B 582 nt5.87□□□□□ -1.47
USB1Q12208 CYB2YML054C 1776 nt5.87□□□□□ -1.47
USB1Q12208 NUP84YDL116W 2181 nt5.87□□□□□ -1.47
USB1Q12208 NTE1YML059C 5040 nt5.87□□□□□ -1.47
USB1Q12208 PAC2YER007W 1557 nt5.86□□□□□ -1.47
USB1Q12208 PAB1YER165W 1734 nt5.85□□□□□ -1.47
USB1Q12208 ECM30YLR436C 3825 nt5.85□□□□□ -1.47
USB1Q12208 YBR241CYBR241C 1467 nt5.85□□□□□ -1.47
USB1Q12208 ERP2YAL007C 648 nt5.85□□□□□ -1.47
USB1Q12208 YHC3YJL059W 1227 nt5.85□□□□□ -1.47
USB1Q12208 YBL070CYBL070C 321 nt5.85□□□□□ -1.47
USB1Q12208 PUS4YNL292W 1212 nt5.85□□□□□ -1.47
USB1Q12208 YOL046CYOL046C 675 nt5.85□□□□□ -1.47
USB1Q12208 SMX3YPR182W 261 nt5.85□□□□□ -1.47
USB1Q12208 NMT1YLR195C 1368 nt5.84□□□□□ -1.47
USB1Q12208 PPH21YDL134C 1110 nt5.84□□□□□ -1.47
USB1Q12208 YDL177CYDL177C 513 nt5.84□□□□□ -1.47
USB1Q12208 MRPS28YDR337W 861 nt5.84□□□□□ -1.47
USB1Q12208 PRI1YIR008C 1230 nt5.84□□□□□ -1.47
USB1Q12208 TMA46YOR091W 1038 nt5.84□□□□□ -1.47
USB1Q12208 SPE3YPR069C 882 nt5.84□□□□□ -1.47
USB1Q12208 GFA1YKL104C 2154 nt5.84□□□□□ -1.47
USB1Q12208 COX15YER141W 1461 nt5.83□□□□□ -1.48
USB1Q12208 SRF1YDL133W 1314 nt5.83□□□□□ -1.48
USB1Q12208 AGX1YFL030W 1158 nt5.83□□□□□ -1.48
USB1Q12208 RPL31BYLR406C 342 nt5.83□□□□□ -1.48
USB1Q12208 SSC1YJR045C 1965 nt5.83□□□□□ -1.48
USB1Q12208 PPS1YBR276C 2424 nt5.82□□□□□ -1.48
USB1Q12208 URH1YDR400W 1023 nt5.82□□□□□ -1.48
USB1Q12208 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.82□□□□□ -1.48
USB1Q12208 NTG1YAL015C 1200 nt5.82□□□□□ -1.48
USB1Q12208 SWD1YAR003W 1281 nt5.82□□□□□ -1.48
USB1Q12208 ICP55YER078C 1536 nt5.82□□□□□ -1.48
USB1Q12208 PLB3YOL011W 2061 nt5.82□□□□□ -1.48
USB1Q12208 NUP49YGL172W 1419 nt5.82□□□□□ -1.48
USB1Q12208 TRS31YDR472W 852 nt5.81□□□□□ -1.48
USB1Q12208 YSC83YHR017W 1158 nt5.81□□□□□ -1.48
USB1Q12208 RPL2BYIL018W 765 nt5.81□□□□□ -1.48
USB1Q12208 HMS2YJR147W 1077 nt5.81□□□□□ -1.48
USB1Q12208 ASR1YPR093C 867 nt5.81□□□□□ -1.48
USB1Q12208 KIN1YDR122W 3195 nt5.8□□□□□ -1.48
USB1Q12208 SLX5YDL013W 1860 nt5.8□□□□□ -1.48
USB1Q12208 ATG36YJL185C 882 nt5.8□□□□□ -1.48
USB1Q12208 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.8□□□□□ -1.48
USB1Q12208 MPA43YNL249C 1629 nt5.8□□□□□ -1.48
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