Protein–RNA interactions for Protein: Q12089

AEP3, ATPase expression protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AEP3Q12089 RIB1YBL033C 1038 nt6.25□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 NSE5YML023C 1671 nt6.25□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 PXL1YKR090W 2121 nt6.25□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 RDR1YOR380W 1641 nt6.25□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 TDP1YBR223C 1635 nt6.25□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 PHO3YBR092C 1404 nt6.25□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 CMR1YDL156W 1569 nt6.24□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 THI4YGR144W 981 nt6.24□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 COX16YJL003W 357 nt6.24□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 ATG17YLR423C 1254 nt6.24□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 ALT2YDR111C 1524 nt6.24□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 YFL052WYFL052W 1398 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 EFT2YDR385W 2529 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 EFT1YOR133W 2529 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 TIF2YJL138C 1188 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 TIF1YKR059W 1188 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 REC114YMR133W 1287 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 PHO85YPL031C 918 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 STE3YKL178C 1413 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 BDS1YOL164W 1941 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 FCY22YER060W-A 1593 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 ATF1YOR377W 1578 nt6.23□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 MHP1YJL042W 4197 nt6.22□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 YNR014WYNR014W 639 nt6.22□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 HST2YPL015C 1074 nt6.22□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 TFC6YDR362C 2019 nt6.21□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 ELP4YPL101W 1371 nt6.21□□□□□ -1.41
AEP3Q12089 GET2YER083C 858 nt6.21□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 SOD2YHR008C 702 nt6.21□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 IRC5YFR038W 2562 nt6.21□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 LAG2YOL025W 1983 nt6.2□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 GDH1YOR375C 1365 nt6.2□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 YNL295WYNL295W 1575 nt6.2□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 YIL168WYIL168W 384 nt6.2□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 TAD2YJL035C 753 nt6.2□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 YPR127WYPR127W 1038 nt6.2□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 HIS7YBR248C 1659 nt6.2□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 AVT4YNL101W 2142 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 MRP1YDR347W 966 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 ORM1YGR038W 669 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 TDH1YJL052W 999 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 MIX17YMR002W 471 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 YNL200CYNL200C 741 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 OST3YOR085W 1053 nt6.19□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 PGI1YBR196C 1665 nt6.18□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 snR82snR82 268 nt6.18□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 YDR401WYDR401W 564 nt6.18□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 PAU21YOR394W 495 nt6.18□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 RPL5YPL131W 894 nt6.18□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 PAU22YPL282C 495 nt6.18□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 KNS1YLL019C 2214 nt6.18□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 YMR074CYMR074C 438 nt6.17□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 ACS1YAL054C 2142 nt6.16□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 CCP1YKR066C 1086 nt6.16□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 LDB19YOR322C 2457 nt6.16□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 DLD1YDL174C 1764 nt6.16□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 GAA1YLR088W 1845 nt6.15□□□□□ -1.42
AEP3Q12089 PSP2YML017W 1782 nt6.15□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 NUP53YMR153W 1428 nt6.15□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 PPH22YDL188C 1134 nt6.14□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 ADE1YAR015W 921 nt6.14□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 YOL099CYOL099C 492 nt6.14□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 OPT1YJL212C 2400 nt6.14□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 CEF1YMR213W 1773 nt6.13□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 YIL055CYIL055C 1884 nt6.13□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.13□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 THR1YHR025W 1074 nt6.13□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 YUR1YJL139C 1287 nt6.13□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 ISC1YER019W 1434 nt6.13□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 HXT17YNR072W 1695 nt6.13□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 RRP43YCR035C 1185 nt6.12□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt6.12□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 BNS1YGR230W 414 nt6.12□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 DYS1YHR068W 1164 nt6.12□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 YJL211CYJL211C 444 nt6.12□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 AIM33YML087C 939 nt6.12□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 YPT10YBR264C 600 nt6.12□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 ENP1YBR247C 1452 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 TUF1YOR187W 1314 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 SPR1YOR190W 1338 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 YJL144WYJL144W 315 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 ERG27YLR100W 1044 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 YOR343CYOR343C 327 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 RGD2YFL047W 2145 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 VHT1YGR065C 1782 nt6.11□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 URH1YDR400W 1023 nt6.1□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 YIL077CYIL077C 963 nt6.1□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 CPT1YNL130C 1182 nt6.1□□□□□ -1.43
AEP3Q12089 SLA2YNL243W 2907 nt6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.5 ms